Обеспечение достойным образованием детей, оставшихся без родительской заботы, является одним из приоритетных направлений деятельности Фонда. Качественное образование – это основа получения достойной профессии и соответствующего качества жизни. В связи с этим,  для подготовки воспитанников домов Милосердия к поступлению в лицеи, колледжи и высшие учебные заведения при Фонде в 2003 году был создан Учебный центр. Также его посещают дети из семей, нуждающихся в социальной поддержке, и дети с ограниченными возможностями здоровья.

Работа Учебного центра нацелена на то, чтобы повысить интерес детей к учебе, создать позитивное отношение к образованию, отслеживать успеваемость детей в школе на основе доверительного отношения с учениками. Специалисты Центра помогают детям в выборе будущей профессии, исходя из способностей и желаний самого ребенка, таким образом, стараются заменить роль родителей и дать ориентиры на будущее.

В Учебном  центре ребята повышают свой уровень образования и  получают новые знания и навыки по естественным наукам и гуманитарным предметам: математике, химии, биологии, физике, узбекскому, русскому, английскому языкам, истории. Они совершенствуют свои ораторские способности и развивают навыки критического мышления в «Клубе дебатов», а на уроках хореографии, в драматической, вокальной и изостудиях дети могут раскрыть свой творческий потенциал, а иногда свои способности, о которых ранее и не подозревали.

Учебный центр Фонда старается привлечь лучших педагогов страны для работы с детьми из домов Милосердия и детей из малообеспеченных семей, чтобы подготовить их к поступлению в средние специальные и высшие учебные заведения. В работе Учебного центра особое место занимают ознакомительные посещения различных учебных заведений, которые помогают детям в выборе будущей профессии.

За годы работы Учебного центра более 2500 детей из домов Милосердия и малообеспеченных семей, а также детей с ограниченными возможностями прошли обучение в Центре. Более 240 выпускников Центра поступили в высшие учебные заведения. Они стали студентами престижных вузов страны, в том числе Университета мировой экономики и дипломатии, филиала Московского государственного университета в Узбекистане, Национального университета Узбекистана, Ташкентского государственного института востоковедения, Ташкентского государственного экономического университета, Ташкентского автодорожного института, Узбекского государственного университета мировых языков, Ташкентского государственного института культуры, Термезского государственного университета, Ташкентской медицинской академии, Национального института художеств и дизайна, Ташкентского химико-технологического института и др.

В Центре также организованы практические занятия по социальной адаптации, способные привить детям жизненные навыки ведения домашнего быта, хозяйства, правила проживания в семье и в обществе, умение строить свою самостоятельную жизнь в будущем.